Die Kongregation des Heiligen Philipp Neri wurde 1794 in Florenz durch Angela Gambi († 1843), die erste Oberin, und den Oratorianer P. Ferdinando Fattoracci CO († 1840) aus der Kongregation des Oratoriums in Florenz (erster geistlicher Rektor) gegründet.
Der Konvent in Bad-Godesberg wurde 1969 für die Ansiedelung der Missionzentrale der Franziskaner errichtet. Der Auftrag der Missionszentrale ist die Unterstützung von Projekten von Franziskanern und Franziskanerinnen in etwa 70 Ländern, Bildungs- und Menschenrechtsarbeit, Vertiefung des franziskanischen Missions-Charismas, sowie Öffentlichkeits- und Lobbyarbeit.
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